證所稅子法今天全部完成，11月16日起接受投資人選擇課稅方式，即使是強制核實課稅對象，若希望個人名下所有股票投資可盈虧互抵，仍須向券商選核實課稅。
證券交易所得稅自明 (102)年起開徵，個人證所稅在102至103年採「設算課稅」與「核實課稅」雙軌制。
財政部賦稅署組長宋秀玲表示，強制核實課稅範圍是按課稅標的及課稅對象區分。個人當年度出售股票中，若有部分屬強制核實課稅者，只會對該部分股票核實課稅，其餘上市、上櫃股票仍可繼續適用設算課稅。
非強制核實課稅對象原則採「設算課稅」，當股價指數達8500點以上，就源扣繳萬分之2。
哪些投資人適合「自選」核實課稅？宋秀玲表示，例如手中有明年將初次上市、櫃股票 (IPO)，會被強制核實課稅；但手中其他股票可能虧損，不想在8500點以上被課稅，投資人可在11月16日至12月15日向券商申請選定適用「核實課稅」，才能盈虧互抵。
宋秀玲表示，股票信託者，如果可能在明年賣股票，應於11月16日前告訴受託人要選哪種課稅方式，由受託人辦理選定。
在法人證所稅部分，過去無長期持有優惠，明年起出售持有 3年以上股票享減半課稅，若有虧損，可在當年或以後5年抵扣。
宋秀玲表示，業者大多希望當年度盈虧互抵，只要盈虧互抵後的金額未超過長期持有賺的錢，可全部算長期持有，享減半課稅；但如果有超過，超出部分需全部課稅。
例如，某企業104年股票投資虧新台幣200萬元，可遞延 5年抵扣；105年長期投資賺200萬元，短期投資賺100萬元，與104年投資盈虧互抵後，盈餘 100萬元，未超過105年長期投資賺的200萬元，可享減半課稅，只有50萬元要計入所得課稅。
資料來源:http://tw.stock.yahoo.com/news_content/url/d/a/121031/1/3gi89.html
